1937—1945年抗日战争时期，我国图书馆、博物馆事业遭日寇严重摧毁。早在1932年，日军就狂轰滥炸商务东方图书馆。七七事变至1938年年底，沿海大部分图书馆均遭到毁损劫夺。湖南大学图书馆于1939年在一次轰炸中20分钟内化为灰烬。重庆大学图书馆和迁入重庆的许多图书馆在轰炸中也多有损失。据统计，抗战时期，在沦陷区和战区共损失图书馆2118所，民教馆835所，藏书损失1000万册以上。日寇还到处抢劫我图书资源，如南京沦陷后各馆贵重图书被劫走70万册以上。各地博物馆的文物、设施也遭抢劫和破坏，据1945年10月“战时文物保存委员会”统计，战时文物损失共360多万件又1870箱，古迹741处。
当时少数图书馆、博物馆到处搬迁。北平图书馆、中央图书馆等辗转迁入四川。北平大学、北平师大、北洋工学院三校图书馆迁入西安，合组西北联大图书馆，后又由西安迁入陕西城固，与陕西省图书馆合并组成城固图书馆。浙江省图书馆则携中西文珍本图书10万册跋涉于永康、丽水、富阳、建德间，其中文澜阁四库全书在1938年3月转移到了贵阳，1944年又迁重庆。其他各省和大学图书馆也被迫西迁。故宫博物院、中央博物院筹备处等博物馆也迁入内地避难。
